Cuando a poco de haber asumido la presidencia Otto Pérez metió sus manos en FLACSO/Guatemala para bloquear el candidato a Director que se había propuesto, con la intención de colocar a uno de sus allegados (supuestamente “izquierdoso”), desató una ola de protestas y se vio forzado a buscar una salida alternativa. Aceptó que se nombrara a una Directora interina, propuesta por la Secretaría General. Uno pensaría que la Directora interina, con el respaldo de profesores y estudiantes y siguiendo los procedimientos establecidos, fuese fácilmente nombrada con carácter permanente.