Sindicatos del Instituto Guatemalteco de Seguridad Social (IGSS) ven obstáculos para investigar la corrupción dentro de dicha institución. Mario Zúñiga, del Sindicato de Médicos Generales y Especialistas, señala que no se logra una investigación efectiva dentro del IGSS porque se mantiene a los mismos miembros de la Junta Directiva, pues solo se ha cambiado al presidente, siendo éste un obstáculo principal que no permite una depuración seria para que los actos de corrupción salgan a luz.
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Entre tanto, Efrén Sandoval del Movimiento Sindical Indígena y Campesino Guatemalteco (MSICG) señala que los actos de corrupción que se han denunciado no han sido investigados por la pasividad del Ministerio Público (MP) y de la Contraloría General de Cuentas, porque aunque existen denuncias públicas se sigue protegiendo a los funcionarios públicos.
Sandoval señala que no solamente el IGSS necesita una depuración, sino todo poder público, porque existen redes que permiten que las leyes no se cumplan, por lo que se necesita una depuración en los tres Órganos del Estado; esto con el objetivo de transparentar todos los procesos que se realizan en las instituciones del Estado para combatir la corrupción, dijo el sindicalista.